特殊教育专业2012年招生，2013年成立特殊教育系，2016年成立特殊教育学院（挂靠教育科学学院）。截至2018年9月，在校本科生402人。现有专任教师14名（含台籍教师7人），其中教授6人，副教授1人，博士9人，在读博士4名。系主任为我国台湾籍著名特教专家吴武典教授。

特殊教育学院建有感觉统合训练室、康复实训室、情绪与行为干预实验室、孤独症干预实验室等11个功能实验室，总面积560平方米，2016年获批广东省特殊教育实验教学示范中心，2017年特殊儿童心理评估与康复实验室获批广东省高校哲学社会科学重点实验室。

特殊教育专业为广东省特色专业，在人才培养方面富有特色，与台湾屏东大学特殊教育系、台中教育大学特殊教育系实施 “3.5+0.5”的本科人才联合培养模式；现已完成2012级-2016级5个年级266名学生赴台研修一个学期的联合培养任务。目前已毕业3届学生，除考上研究生之外，大都在珠三角地区特殊教育学校及相关机构就业，毕业生100%就业；2017年6月受广东省教育厅委托，岭南师范学院以特殊教育专业为依托，牵头成立广东省特殊教育教师发展联盟，当选为理事长单位。2018年开始与白俄罗斯国立师范大学全纳教育学院联合培养特殊教育专业硕士和博士研究生。